巴彦淖尔市区位优越，有369公里的中蒙边境线和常年开放的甘其毛都口岸，是“一带一路”重要节点城市，处于“呼包银榆”经济圈，是国家西部大开发的重点区域，是国家“十纵十横”综合路网的重要交汇点。巴彦淖尔市成为沟通大西北、贯通大西南、连接蒙古国的重要枢纽。
铁路：包兰铁路横贯全市，进疆通道一临哈铁路建成通车，中蒙铁路运煤专线一甘泉(甘其毛都一包头万水泉)铁路建成运营，三条铁路在我市交汇。途径我市的包银高铁已开工建设，成为国家八横八纵高速铁路网(北京至兰州大通道)的重要一环。
公路：110国道和京藏、京新高速公路横贯东西，国道242贯穿南北，市内公路四通八达，公路运输畅通。
航空：巴彦淖尔机场航班直达北京、上海、成都、郑州、广州、重庆、西安、呼和浩特等枢纽城市。
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